Du beskriver det hela lite luddigt så det är svårt att förstå...
Jag tolkar det som att du jobbade med datorn igång och fläktarna snurrade innan du stängde av? Denna kontakt som du tog bort, trasslade den in sig i fläkten så att den stannade? Jag skulle prova att koppla ur den där sidfläkten i chassit... känns som det kan ha hänt något med den.
En fråga till... vad var det för kontakt som var i vägen som du "tog bort"? Kopplade du ur den eller flyttade du bara på den?
EDIT: Kom också på att om min tolkning stämmer, alltså att du helt tvärt stängde av datorn genom att slå av brytaren på nätagget, så kan detta vara orsaken till dina problem. Det är aldrig bra för datorer att hastigt stängas av på det viset då de kan vara inne och skriva i systemfiler exakt vid det tillfället då strömmen bryts.